Les gymnadenia ont la réputation de répandre une légère odeur de vanille et cette espèce ne dérogera pas, même si parfois les fleurs peuvent être inodores.

Gymnadenia odoratissima sera très difficile de différencier en dehors justement d'une odeur plus prononcée et d'une taille inférieure. Sur le terrain donc, à moins de disposer de 2 populations à observer en parallèle, nommer l'une et l'autre demande de mesurer les fleurs. Les autres différences morphologiques sont assez subtiles et tiennent à la taille des fleurs, à la forme du labelle notamment.  L'aire de répartition étant incluse dans celle de Gymnadenia conopsea, ça complexifie encore plus la tâche.